Skripsi Biologi

Analisis Keragaman Genetik Berbasis Marka RAPD Pada Tanaman Kopi (Coffea spp.) Asal Desa Dombu, Rano Dan Bangkir

---

Marka RAPD dapat digunakan untuk mendeteksi keragaman genetik dari berbagai
spesies kopi. Pada penelitian ini, 10 primer RAPD digunakan untuk menganalisis
keragaman genetik dari 6 genotipe kopi lokal dari desa Dombu, Rano dan
Bangkir. Profil pita DNA diterjemahkan ke dalam data biner dengan ketentuan
nilai 0 untuk tidak ada pita dan 1 untuk adanya pita DNA. Data hasil scoring
digunakan untuk menghitung tingkat polimorfisme serta hubungan kekerabatan
menggunakan koefisien kesamaan Jaccard dan metode kluster UPGMA. Jumlah
pita yang dihasilkan adalah 75 pita, dengan persentase polimorfisme sebesar
100%. Ditemukan bahwa DNA kopi Tipika dan Liberika yang berasal dari Desa
Dombu, Robusta dan Dara dari Desa Rano, Lokal Bangkir dari Desa Bangkir
dapat diamplifikasi dengan primer OPA-01, OPA-02, OPA-07, OPA-16, OPD-08,
OPG-03, OPI-07, OPY-10 dan OPX-20. Tetapi tidak dapat digunakan untuk
amplifikasi genotipe kopi Robusta Dombu. Analisis kluster mengelompokkan
genotipe tersebut ke dalam 3 kluster utama berdasarkan desa asalnya. Robusta
Rano dan Dara Rano memiliki koefisien kesamaan terbesar yaitu 57%. Penelitian
ini menunjukkan bahwa genotipe kopi lokal Desa Dombu, Rano dan Bangkir
memiliki genetik yang beragam.

Kata Kunci: Keragaman genetik, Kopi lokal, Robusta, Arabika, RAPD

---

Ketersediaan

Informasi Detail

Judul Seri

-

No. Panggil

570.072

Penerbit

Palu : FMIPA Universitas Tadulako Jurusan Biologi., 2024

Deskripsi Fisik

xv, 31 hlm, ilus,.; 30 cm

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

G 401 20 048

Klasifikasi

570.072

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

Penelitian - Biologi

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

Nurfadilah

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar