Skripsi Biologi
Analisis filogenetika diospyros celebia bakh. Berdasarkan lokus trnF-GAA genome kloroplas
Analisis fitogenetika pada Eboni (Diospyros celebia Bakh), dilakukan untuk melihat kekerabatan antar spesies maupun subspesies. Hal ini dilakukan dengan cara identifikasi berbasis molekuler, menggunakan penanda lokus trnF-GAA. Metode yang digunakan ialah experimental dan analisa in silico. Proses experimental antara lain; Pengambilan sampel dilakukan pada dua lokasi di Provinsi Sulawesi Tengah, yakni Maleyali Kecamatan Sausu dan Enu Kecamatan Sindue, isolasi DNA, amplifikasi lokus trnF-GAA, pemurnian hasil PCR, elektroforesis DNA dan perunutan/sekuensing lokus trnF-GAA. Analisi in silico dilakukan untuk, analisis sekuens, BLAST NCBI, Pembuatan peta locus trnF-GAA, pembuatan peta circular genome lengkap Diospyros celebica dan rekonstruksi pohon filogenetik. Dalam penelitian ini, dibuktikan bahwa lokus trnF-GAA dapat digunakan sebagai penanda antar spesies dan belum bisa antar subspesies. Berdasarkan rekonstruksi filogenetik letak Diospyros celebica dan sampel lainnya yang berbeda-beda, dapat disimpulkan bahwa lokus trnF-GAA dapat dijadikan sebagai penanda biogeografi.
KAta kunci: Eboni (Diospyros celebica), trnF-GAA, DNA fingerprint, kloroplas genome, analisis fitogenetik
Tidak tersedia versi lain